Farmakonisi (ou Pharmakonisi, Farmaco, Pharmakoussa) est une petite île du Dodécanèse, située à 14 M à l'E de Lipsi, près de la côte turque. Elle fait partie de la municipalité de Leros.

Elle fait 16 km² de large.

Ces dernières années, la présence militaire sur l'île interdit le mouillage dans la baie de la côte E.
 Mais il est déjà arrivé que les restrictions soient levées.

Plutarque nous raconte que Jules César, alors qu'il voyageait en Asie, fut pris par des pirates et séquestré 38 jours contre une rançon. A sa libération, après versement de la rançon, lança une espédition et captura les pirates qui furent tous crucifiés.