L'île est située au N du détroit d'Elafos, entre Cythère et le Péloponnèse. Elle est séparée du Péloponnèse par un détroit peu profond. Elafonisos signifie "l'île aux cerfs".

Dans l'Antiquité c'était un comptoir commercial et l'île était connue sous le nom d'Onugnathos, ce qui signifiait "mâchoire de l'âne".

Il y a plusieurs mouillages autour de l'île et un petit port au village d'Elafonisos au NE.